南京大学生态学学科点长期致力于湿地生态、森林生态、盐土生态、分子生态、生态工程、全球变化、城市生态、进化生态、景观生态、草地生态、生物入侵等领域的科学研究，取得了国内外知名的研究成果，先后获得了国家自然科学大会奖、国家科委、农业部、国家教委（教育部）、海洋局以及江苏省政府的各种科技奖励30余个。1995年以来，先后争取到国家973项目课题、863水专项课题、海洋863项目，国家重点科技攻关计划与科技支撑项目，国际合作，国家自然科学基金重大项目、重点项目，World Wild Fund for Nature(WWF)、Luce Foundation、科技部研究与开发专项基金、江苏自然科学基金、农业部科技攻关计划、江苏重点农业攻关计划、国际合作基金、教育部留学归国人员基金、教育部优秀青年教师基金、教育部高等学校骨干教师资助计划和地方合作等科研项目100余个，合同经费9000多万元；目前主持的在研项目50多个，经费3750余万元。发表科研论文500余篇、著作（教材）20余部；其中，《生态工程学》在2001年被教育部列为全国研究生教材，《生态学》于2007年成为国家精品课程。
